mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA TGATTATCCCCTGATCAGTCCTGTCGTCAATTATATGTGTGTGTAGTACTCTGTACTCATACAT GCTGATTCGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAATGCCTATGTGCATGTGTTTATACGCTGCTCATCTGCATTTTGATTATCCCCTGATCAGTCCTGTCGTCAATTATATGTGTGTGTAGTACTCTGTACTCATACATATATAGGCATGTCTTCCTTGGCTATTCGGAGCGG 3 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 3e-92 zma-MIR169f 0.00000003 -68.7 .(((.(((((((((((((((.(((.((((.(((((..(((.(((.((((....))))))).)))..)))))(((((((.....))))))).............((((((((((((.(((((...))))))))))))))))))))).))).)))))))))).))))).))) (-68.70)