mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC CTGCCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATTGTGCTCTTCTGAATGATGCAGTGCCATGATCAGTGTGGCCTGGCTGGTTCAGATGAGCCGAGATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGGC 0 3 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 4e-66 zma-MIR169g 0.0000000001 -67.4 ..(((.((((((((((((((.((((.(((((((..((((.(((((((.(.((((.(((((.......))))))).))).))))))).))))...)))))))))))))))))))).)))..)).))) (-67.40)