mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC TTAGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTGTAAGGATCATTAATTATTATTCAGAAAATGATCCTTTCAGCAGGTTTCATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGAT 0 3 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 9e-64 osa-MIR169i 1e-16 -58.36 ...((((.((((((((((((.((((.(((((((..(((((.((.((((((((((...............)))))))))).)))))))...)))))))))))))))))))).))).))))... (-58.36)