mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGT GTAGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTTGTGTAGAGGATCATTCAGAAAATGAGCCTTGAACTGGTTCATAGGCAGTCTCCTTGGCTAGTCTGAGTCG 0 2 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 2e-55 osa-MIR169h 9e-17 -52.2 ...((((.((((((((((((.((((.(((((((..((.((...((((.(((((.....))))).))))..)).))..))))))))))))))))))))).)).)))).. (-52.20)