mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC TCGCATCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCTCTGCTCATGTGCAGTAGAAGAAGATGCATTTCTAGCTGCTTTCTGCATATGTGATCTCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGCGGC 0 3 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 1e-65 osa-MIR169i 0.0000000004 -61.5 ((((.((.((((((((((((.((((.(((((((......(.(((((((((.((.((.(((......)))..)).))..))))))))).)....)))))))))))))))))))).))).)))))). (-61.50)