mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGC TTATCTCTGATAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCCTCCCTGAAGGATTAGCAATTTAATGATCCTTTAAGCTGGTTCATGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGTGG 0 2 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_5 2e-55 osa-MIR169q 1e-56 -49.6 ....(((...((((((((((.((((.(((((((.((..(.((((((((((.........)))))))))).)..))..)))))))))))))))))))))....)))... (-49.60)