mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGACAAACTTGCCGG GGCAAGTCATCCTTGGCTGCA GAGCAAGGTGTAGCCAAGGACAAACTTGCCGGATCAACAGAGAAGGACTGCCAGTCTCCGGCCAATTAATTAACCTCGCCGTCGGCCATCGCCGGCCGGCAAGTCATCCTTGGCTGCATCCTGCTC 2 1 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR169_2 4e-66 bdi-MIR169f 0.0000000000001 -62.16 (((((.((((((((((((((...(((((((((.......((((.((....))..))))((((...............)))).((((....)))).)))))))))..)))))))))))))).))))) (-62.16)