mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAA CTTTGTGGTCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGCATCTTTGAGAGAGATTAGCATCCCTATGTGTGGATTTTGCTTGCACGAGTGTGCAGTTCAATAAAGCTGTGGGAAATTACAGAG 1 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR396 3e-60 zma-MIR396h 0.00000000002 -52.8 (((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((..(((((.((((......)))).)))))..))))...))).))))))))))).)))))))))))).))))))))) (-52.80)