mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATTAGTGTATAAACATCCGAT CGAATGTTTGACGCTAATTTGGA CCGTGTCACATCGAATGTTTGACGCTAATTTGGAGTATTAAACATAGACTAATAAAAAAACTAATTTCATAAATGAAAGCTAATCTGCGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAATCCATAATTATGAAAAGTTTACTAATCATGGTGTAATTAGGCTTAAAAGATTCGTCTCGTGAATTAGTCCAAGGTTATAGAATAGGTTTTATAATTAGTGTATATTTAATACTCTAAATTAGTGTATAAACATCCGATGTGACATA 1 1 3' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR445e 9e-124 -119.7 ..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((.(.((((((.(((..((((......((((((..(((((((((((((((((((((((((((..((((.(((((((.....))).)))).))))..)))))))))))))))))))))))))))..))))))......))))..))).)))))).).)))))).))).))))))))))))))))))))).))))))).))))))))))). (-119.70)