mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATTAGTGTATAAACATCCGAT CGAATGTTTGACGCTAATTTGGA GTCCGTGTCACATCGAATGTTTGACGCTAATTTGGAGTATTAAACATAGACTAATAAAAAAACTAATTTCATAAATGAAAGCTAATCTGCGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAATCCATAATTATGAAAAGTTTACTAATCATGGTGTAATTAGACTCAAAAGATTCGTCTCGCGAATTAGTCCAAGGTTATAGAATAGGTTTTATAATTAGTGTATGTTTAATACTCTAAATTAGTGTATAAACATCCGATGTGACAGGGAC 1 1 3' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR445f 4e-135 -123.1 ((((.((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(.((((((.(((..((((......((((((.(((((((((((((((((.((.(((((((..((((.(((((((.....))).)))).))))..))))))).)).))))))))))))))))).))))))......))))..))).)))))).).)))))).))))))))))))))))))))))))).))))))).)))))))))).)))) (-123.10)