mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGAGAGAGAGTACAGCTT GCTGTACGCTCCCTCTTCTTC ATCGTGAAGGCTAAATGGAGAAGAGAGAGAGTACAGCTTTGGGCGGTTTAGTTGTTAGATGGTGGAAGTACTTGCGACGCCTACTACCCTTTTCACCAAGGCTGTACGCTCCCTCTTCTTCTCTTAGCTTTTTATGAT 2 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR529 2e-71 bdi-MIR529 0.0000001 -59.6 ((((((((((((((..(((((((((.(((.((((((((((((..((..((((........((((...((....))..)))).))))..)).....)))))))))))).))).)))))))))..))))).))))))))) (-59.60)