mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAACGAGAGAGAGCACGC GTGCTTTCTCCCGTTGTCACT GGCGGTGACAACGAGAGAGAGCACGCCGGTGCGGCGGTCACGGTGAGCCGGCCCGCGGCGGCGTACCTGCGTGCTTTCTCCCGTTGTCACTGCC 1 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR535 5e-46 ppt-MIR535d 0.00000007 -68.3 (((((((((((((.((((((((((((.((((((((((.(.(((....)))).)))).....)))))).)))))))))))).))))))))))))) (-68.30)