mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG CCGTTGACTTTTTAAATACGTGT TACGTATATACTCTCTCCGTTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAAATACGTGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTTATTCTTTTCATACATTTGATTCATTGTTAAATATACTTTCATGTACACATATAGTTTTACGTATTTCAAAAAAAAATTTAATAAGACGAACGGTTAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTTAAAACGGAGGGAGTATTTGTG 1 1 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 3e-81 osa-MIR806c 2e-75 -102.44 ((((...(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((((((((.(((......(((((..((((((......(((......)))........)))))))))))..(((((.((.....))..)))))..............)))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).)))) (-102.44)