mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG CCGTTGAGTTTTTAATACGTGT CTCCCTCCGTCCGAAATACTCCCTCCTTTCAAAATGTTTGATACCGTTGAGTTTTTAATACGTGTTTGACCATTCGTTTTATTCAAAAAATTTAAATAATTATTTATTCTTTTCATATCATTTGATTCATTGTTAAATATACTTTCATATGCACATATAGTTTTACATATTTCACAATTTTTTTAGAATAAGACTAACGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTTAAAACGGAGGGAGTATAAGGGATTTTAGGTGG 2 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 6e-76 osa-MIR806g 5e-76 -99.74 (..(((..((((...((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((.((.(((((((((((((((......................(((.......)))...(((((.((((((.......((((....)))).......)))))).))))))))))).))))))))).)).))))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))).))).)))))))))))...))))...)))..) (-99.74)