mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG CCGTTGACTTTTTAGCATATGT TTAGGTAATACTCCATCCGTTTCAAAATGTTTGACGCCGTTGACTTTTTAGCATATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTCTTTTCTTATCATTTAATTTATTGTTAAATATATTTTTATGTAGGCATATAATTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTAAATAAGACGAACGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTCGAAACGGAGGGAGTGTGGTTTAG 0 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 4e-46 osa-MIR806f 2e-47 -120.3 .((((..(((((((.((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((..((......................(((((((.....))))))).......((((((((........))))))))....))..)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).)))))))..)))). (-120.30)