mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG CCGTTGACTTTTTATCATATGT CTGAAATAGATAGTACTCCCTCCGTTTCGAAATGTTTAACGCCGTTGACTTTTTATCATATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTCTTTTCCTATCATTTGATTCATTGTTAAATATATTTTTATGTAGGCATATAATTTTACATATCTCACAAAAGTTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTAGAAACGGAGGGAGTAGTATGTTTATTCGCTTCAG 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 6e-107 osa-MIR806e 3e-105 -123 ((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.(((..........................(((((((.....))))))).......((((((((........)))))))).......))).))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))).)))))))))))))))...)))))))....))))) (-123.00)