mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATGTGAGAAATGTTAGAAT TATAGCATTTTTCAAATTCATA TGTACTCCTTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTATAGCATTTTTCAAATTCATATTGAGGTTAATGAATCTATATAGATATATATATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGAGAAATGTTAGAATGACTTACATTGTGAAATGGAGGGAGTAACA 2 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 5e-29 osa-MIR808 1e-32 -95.3 ..((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((....((((((....)))))))))))))))))).))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))... (-95.30)