mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAATGTGAGAAATGTTAGAAT TCTAACATTTCCTACATTTATA TACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGTTATTCTAACATTTCCTACATTTATATTAATGTTAATGAATCTAGACATCATTAACATCAATATGTCTAGATTTATTAACATCAATATGAATGTGAGAAATGTTAGAATAACTTACATTGTGAAACGGATGAAGTA 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 1e-35 osa-MIR809d 5e-44 -92.3 ((((.(.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((......))))))))))))))))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))) (-92.30)