mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGACGGATGATTAAAGTTGGACA CCCAACTTTAATCATCTGTTTTAT TTGTACTCCCTCCGTCCCATTTTAAGTGCAATCATGAGTTTCGCCCAACTTTAATCATCTGTTTTATTTGAACTTTTTATAAATAGTATTTTTATTGTTATGAGATTATAAAATTTAAATAAGACGGATGATTAAAGTTGGACACGAAAACTCATGGCTACACTTACAATGAAATGGAGGGGTACTA 3 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 2e-19 osa-MIR812g 3e-21 -83.71 ..((((.((((((((..((((.((((((.(..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((....)))))).......))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)).)))))))))..).)))))).))))..)))))))))))).. (-83.71)