mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGAACGGTTAAAGTTGGACGCGG GCGCCCAACTTTGATCGTCCGTCT AGTCATAAGTTTCCGCGCCCAACTTTGATCGTCCGTCTTATTTGAAATTTTTTTATAATTAGTATTTTTTGTTGTTATGAGATAATAAAATATGAATAGTACTTTACTCGTGACTTATGTTTTTAATTTTTTTTAAAAAAATTATAAATAAGACGAACGGTTAAAGTTGGACGCGGAAAACTATAGCT 2 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 1e-30 osa-MIR812k 3e-27 -66.01 ((..(((..((((((((.((((((((((((((.(((((((((((.((((((((((.((((((...........((((((((....((((.(((.....))).))))))))))))........)))))).....)))))))))).))))))))))).)))))))))))))).))))))))..)))..)) (-66.01)