mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTGTTCAACGTTTGACTGTC CGGTCAAATGTTAGACACGGA GGTTTTCGTGTTCAACGTTTGACTGTCTATCTTATATGAAAATTTTTTTATTAGTATTTTTATTATTGTTAGATGATAAAACATGAATAATACTTTATGCATGACTTATCTTTTTAATTTTTTTCATAATTTTTTTAAATAAAATGAACGGTCAAATGTTAGACACGGAAACT 3 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR812 6e-38 osa-MIR812o 4e-45 -48.8 (((((((((((..(((((((((((((.(((.((((.((((((.........(((((....)))))..((((((.(((((..((((.((((....)))).))))..)))))..)))))).............)))))).)))).))).)))))))))))))..))))))))))) (-48.80)