mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACTTCATAGTACAACGAATCT ATTCGTTGTACTATGAAGTGTC ACCTAGTACCGGACGAGACACTTCATAGTACAACGAATCTGGACAGTAAGCCTGTCCAGATTCGTTGTACTATGAAGTGTCATATCCGGTCCTAAGT 0 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 6e-49 osa-MIR814c 9e-20 -66.5 ((.(((.((((((...((((((((((((((((((((((((((((((.....))))))))))))))))))))))))))))))...)))))).))).)) (-66.50)