mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGGGATTGAGGAGATTGGG CCTCTCTTCTCTCCTCCA CTTCTCCTCTCTTCTCTCCTCCACCTCAGCATTTAGCCGGCTTATAGCCTATACTTCCTCTAAGGGTGTGTTTGAGGAGAAGGGGATTGAGGAGATTGGGAAG 2 3 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR815 3e-17 osa-MIR815a 0.000000000000001 -38.7 ((((((.(((((((((((((.(.((((((.........(((.....))).((((.(((.....))).)))))))))).).))))))..)))))))..)))))) (-38.70)