mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCCCTTATATTATGGGACGG ATCCCATAGTATAAGGGATTTG TCCCTCCATCCCATAGTATAAGGGATTTGGGAATGATGTGACATATCCTAGTATAATGAATCTGGACAAACCGTCTGTCCAAATTCATTGTCCTAGTATGTGTCACATCTACTCAAAATCCCTTATATTATGGGACGGAAGGGA 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 1e-35 osa-MIR1442 0.0000001 -85.1 (((((((.(((((((((((((((((((((((...((((((((((((.((((.(((((((((.((((((.......)))))).))))))))).)))).))))))))))))..))).)))))))))))))))))))).)).))))) (-85.10)