mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTTATAAGACTTTCTAGC TAGAAAGTCTTATAATATGAAA CCTCCGTTTCAGGTTATAAGACTTTCTAGCATTGCCCACATTCATATAGATGTTAATGAATCTAGGCATATAACATCTATATGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAACGGAGG 1 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 7e-40 osa-MIR819d 2e-36 -91.1 (((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((........))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))) (-91.10)