mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTTATAAGACTTTCTAGC TAGAAAGTCTTATAATATGAAA TACTACCTCCGTTTCAGGTTATAAGACTTTCTAGCATTGCCCACATTCATATAGATGTTAATGAATCTAGGCACACATATATGTCTAGATTCATTAGCATATATATGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAACGGAGGAAGTA 1 0 5' arm Oryza_sativa mirbase MIR1122 3e-61 osa-MIR819c 3e-79 -109.9 ((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((........))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))).)))) (-109.90)