mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGATAATGCCATGAATTTG AATTCACAGGCCCTATCTTGTG GCGCTTGGCGAATTCACAGGCCCTATCTTGTGGTATGAACTGGGTACGCGATGATTTGCACTGCGTATTGGGGGCTTACCATAAGATAATGCCATGAATTTGTCAAGCGT 3 1 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR1428 1e-56 osa-MIR1428e 6e-58 -60 ((((((((((((((((..(((..((((((((((((.(..((.((((((((.((.....)).)))))))).))..).))))))))))))..))).)))))))))))))))) (-60.00)