mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGGCTACTACACCATCCATAAG TATGGATGGAGGTGTAACCCGATG CCATAATCATCTATTAGTACAGTGGTGAAGACATAGGGCTACTACACCATCCATAAGGGTTCGAATCTTCGATGTGCCTAGATAGGGTACAGTTGGATCCCATATGGATGGAGGTGTAACCCGATGCCTTTTACAAATAGATGGTTATTTT 4 2 5' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR1874 3e-82 -57.91 ..(((((((((((((.(((.......((((.(((.(((.(((.((.(((((((((.((((((((........(((((((.....))))))).))))).))).)))))))))..))))).))).))).))))))).)))))))))))))... (-57.91)