mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTAATCTGGACACTATAAAAGA ATTTGTAGTGTTCAGATTGAGTTT ACCACTGCAGACTTAATCTGGACACTATAAAAGAAAATTGTGCATGTGAAAATATGCCCATTATAAATTTGTAGTGTTCAGATTGAGTTTAGAATGGTTG 3 0 5' arm Oryza_sativa mirbase 100 bdi-MIR1878 0.000000000005 -41.94 ((((...((((((((((((((((((((((((.......((.((((((....)))))).)).......))))))))))))))))))))))).)..)))).. (-41.94)