mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATCTTCCAATTAATGCAT GCATTAATTGGAAGAACACA ACTGGATGTGTGCATTAATTGGAAGAACACATCTTCCAATTAATGCATTCTTCCTAGA 3 0 3' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR2093 3e-27 -28.8 .(((((...(((((((((((((((((.....)))))))))))))))))...))).)). (-28.80)