mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTCGATGCCTCCCATTCCTA GGACTGGGAACATATGAGAAAG GGGAAGAGGAAGAAAGAGAGGCTCCAAGAGTAGTAGGACTGGGAACATATGAGAAAGCATGAGCTCTATCCATCTATCCATCCCCTCCCATTCGCTAGAATGTTGCAGGTGGAGATTTCGCTCTTATGTTTTCTCGATGCCTCCCATTCCTATCGTTCTTGGAACTTCCTTCCTCTTCC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 1e-97 osa-MIR2118n 0.000000009 -82.7 .(((((((((((.....((((.((((((((..((((((.(((((.(((.(((((((((((((((...(((......((((((..(...(((((....)))))..)..)))))))))...))))..))))))))))))))..))))).))))))..)))))))).))))))))))))))) (-82.70)