mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTGATGCCTCCCATGCCTA GGCATGGGAACATGGAGGAAAG GTGGATCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTGAGAGCGGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAAGCCCAAACTCTTCTTCGCCTCTAGAACTAGGGGCTGAGATTTGGTTTCCTTGTTTTCCTGATGCCTCCCATGCCTATTGTTCTCAGATGCTCCTTCCTCTTCCTTTTGGTTCGC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 1e-91 osa-MIR2118p 3e-27 -100.6 (((((((((((((((((((....(((.(((((((((((((((((((((((.(((.(.(((((((..(((((..((((.(((((((....))))))).))))...)))))....)))))))).)))..))))))))))))))))))))))).))))))))))))))...)))))))) (-100.60)