mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCAATGCCTCCCATGCCTA GGCATGGGAACATGGAGGAAAA AGTGAGTCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGAGTCTAAGAGCAGCAGGCATGGGAACATGGAGGAAAAAACATATATAGTTTTCTTCCCCTCTAAAGTTAGAGGTTGAAATTTGCTGTGTGTTTTTCCCAATGCCTCCCATGCCTACAGTTCTTAGGCACTCCTTCCACTTCCTGTTGGCT 3 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 2e-93 osa-MIR2118r 9e-46 -81.4 (((.((.(((((((.(((((....(((.((((((((((.(.((((((((((.(((.(.((((((...(((((((((....(((.((((((....))))))..)))....)))))))))))))))).)))..)))))))))).).)))))))))).)))))))).))))))))).))) (-81.40)