mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTGATGCCTCCCATTCCTA GGAATGGGAACATGGAGGAAAG GTGAGCCAGGGAAGAGGAAGAACGAGAGGGTTCAATAGCAGTGGGAATGGGAACATGGAGGAAAGCATGAGCTCTAAATTTCCTCCAAAGGAGATCCTGCTTTGTGTTTTCCTGATGCCTCCCATTCCTATTGTTCTTGGGTGCTCCTTCCCCTTCCTTCTTGGCTTGC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 3e-86 osa-MIR2118k 6e-19 -83.2 (..(((((((((((.(((((.....(((.(..(((.((((((((((((((((.(((.(.((((((((..(((.....(((((((....)))))))...)).)..))))))))).)))..)))))))))))))))).)))..).)))))))).))))))...)))))..) (-83.20)