mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTAATGCCTCCCATTCCTA GGAATGGGAACATGGAGGAAAG GTGAACTTGGGAAGAGGAAGACAGAGGGTCTAAGAGCTGTAGGAATGGGAACATGGAGGAAAGTGCAAGCTCCATGTTTGTGGAGACTTGGCTTGCAACTTTCCTAATGCCTCCCATTCCTATTGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTGGTCTCAC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 2e-81 osa-MIR2118k 6e-19 -88.6 (((((((.((((((((((((...(((.((((((((((.((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((....)))))......)))))).)))))))).)))..)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))))..))).)))) (-88.60)