mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTGATGCCTCTCATTCCTA GGAATGAGAACATGAAGGAAAG GGAAGAGGAAGAAAGAGAGGATCTCAGAAATGTAGGAATGAGAACATGAAGGAAAGTCTAAGAGCTAATGTCTCCTCTACATTGGAGGTCGAGACTTAGTTTCATGTTTTCCTGATGCCTCTCATTCCTATGGTTCTAGGGTGCTCCTTCCTCTTCC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 2e-84 osa-MIR2118k 8e-46 -72.2 (((((((((((.....(((.(((..((((..((((((((((((.(((..(((((((.(...(((((((.(((((((((.....)))))...)))))))))))...)))))))).)))..))))))))))))..))))..))).)))))))))))))) (-72.20)