mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTGATGCCTCTCATTCCTA GGAATGAGACCATGAAGGAAAG GCAAGCCAGGAAGAGGAAGAAAGAGAGTATCTCAGAATTGTGGGAATGAGACCATGAAGGAAAGCCTAAGCTCTATTGTCCCCTCTAGTATTGGAGGTGGAAACTTAGTTTCATGTTTTCCTGATGCCTCTCATTCCTATTGTTCTTAGGTGCTCCTTCCTCTTCCTTTTGGCTTGC 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 1e-51 osa-MIR2118h 9e-46 -89.4 (((((((((((((((((((.....((((((((.(((((.((((((((((((.(((..((((((((..(((((......(((((((((....)))))).))).....)))))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).)))))))))))))))))))...)))))))) (-89.40)