mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTAATGCTTCCCATTCCTA GGAATGGAAACATTAAGGAAAG AGCGAGTTAGGAAGAGGAAGAAATTGAGTGTCTAAGAACAGTGGGAATGGAAACATTAAGGAAAGCCTACAGTATTTTCTTCTCCACTAGAATTAGGGGTGGAGATAATTCTTTTGTGTTTTCCTAATGCTTCCCATTCCTATTGTTGTTAGATACTCCTTCCTCTTCCTTTTGGCT 1 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 2e-93 osa-MIR2118i 8e-34 -85.59 (((.((..((((((((((((.....((((((((((.((((((((((((((((.(((((.(((((((..((((........((((((((.........))))))))........)))))))))))))))).)).)))))))))))))).)))))))))))))))))))))).)).))) (-85.59)