mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCGATGCCTCCTATTCCTA GGAATAGGAACATGGAGGAAAG GTGAGCAGGGAAGAGGAAGAAAGAGAGCCTCTAAGAGCGATGGGAATAGGAACATGGAGGAAAGCCTGAAGCTAAATTTTCTACTCCAGTATCGGAGTTAGAAATTTGCTCTGCGTTTTCCCGATGCCTCCTATTCCTACCGATCTTAGGTACTCCTTCCTCTTCCTTTAAGCTCAT 2 2 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 8e-62 osa-MIR2118c 3e-30 -85.9 (((((((((((((((((((...(((.((((..((((.((.(((((((((((.(((.(.(((((((.(..(((.(((((((..(((((......)))))..))))))))))..).)))))))).)))..))))))))))).)).)))))))).))))))))))))))))...)))))) (-85.90)