mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCAATGCCTCCCATGCCTA GGCATGGGAACATGGAGGA GTGAGTCGGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGTCTAAGAGCAGTGGGCATGGGAACATGGAGGAAGAACATGTACTTTTCTTCCCTCTAAATTTAGAGGTTGAGATTTGCTAAGCATTTTTCCCAATGCCTCCCATGCCTACAGTTCTTAGGTACTCCTTCCCCTTCCTGTTGGCTTGC 1 3 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR2118 5e-91 osa-MIR2118e 9e-46 -81 (..((((((((((.(((((....(((..(((((((((.((((((((((((.((((((((((......(((..((((...((((((....))))))..))))..)))......)))))))..)))..)))))))))))).)))))))))..)))))))).))))))...))))..) (-81.00)