mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAAAGTCAACGGTGTCAAAC TTGACACCGTTGACTTTTTAGG TTTGACACCGTTGACTTTTTAGGACGTGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAAAATTTTAAGTAATTATTTATTCTTTTCATATCATTTGATTCCTTGTTAAATGTATTTTCATGTACACATCTAGTTTTACATATTTCACAAGACGAACGGTCAGACATGTACTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACA 1 0 3' arm Oryza_sativa mirbase MIR806 3e-58 osa-MIR2123b 3e-101 -71.8 ((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((......................................((((((((.....)))))))).......(((((.((.....))..))))).......)))))))).)))))))))))).)))))))))))))))))))))).. (-71.80)