mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTTTAAATGTGTGTCCGTATATT TGTTTGGACACATGCATGGAGTAT ATGTTTGGACACATGCATGGAGTATTAAATATAAAAAAAAACCAATTACACAAATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACAATAAACATTTGCTAATGACAGATTAATTAGACATAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAGGCGGAATATGTAATTTGTTTTGTTATTAGTCTACGTTTAATACTTTAAATGTGTGTCCGTATATTC 4 0 3' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR2124a 5e-76 -78.6 ((((.((((((((((..(((((((((((((((((...(((((.(((((((....((((.(((((((((((((((((((...(((.(.((((((((.((((...........)))).)).........((((....)))).......)))))).).)))...))))))))))))))))))).))))....))))))).))))).))))........)))))))))))))..)))))))))).)))).. (-78.60)