mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTTTCCTCCAATATCTCA AGGTTTGGATGGGACCAAATC TGGCAGCTGAATTTGAGGTTTGGATGGGACCAAATCTTACTGCAGACTTGCAGAGCAAGACAAGATTTGGTTTCCTCCAATATCTCATGTTCAGTTGTCA 3 1 3' arm Oryza_sativa mirbase 100 osa-MIR2275a 5e-40 -49.6 .(((((((((((.(((((((((((.(..((((((((((.((((......))))........))))))))))..).))))).)))))).))))))))))). (-49.60)