mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GAGCTCCTATCATTCCAATGA CCTGATGCTTGGATTTGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGCCGTTCTGAAGGGTTGTTCCGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCATCATGTATGTGTGTATGTATTTTCGAGAGGGAGGAGAGGAGCTAGACTCTCATGGGGGTCGTCTATGAGATACGCTTGTGGTTTGCATGACCGATGAGCTGCACCGTCCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCCTGATCCATCCATCC 3 0 3' arm Saccharum_officinarum mirbase MIR159 3e-65 sof-MIR159a 2e-140 -107.02 ...((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..((((((....(((((.......((..(((((..((((..((((...((((.((((.....((((((....))))))....)))))))).(((((........))))).))))..))))..)))))....(((..(((((.....)))).)..))).))......))))))).))))..)).))))).))).))))))))))).))..))))))..)))). (-107.02)