mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAAGGAGCTCTT AGCTCCTATCATTCCAATGA CTGATGCTTGGATTTGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGCCGTTCTGAAGGGTGGTTCCGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTCATCATGTATGTGTGTATGTATTTTCGAGAGGGAGGAGAGGAGCTAGACTCTCACGGTGGTCGTCTTTGAGATAGGCTTGTGGTTTGCATGACCGAAGAGCTGCACCGTCCCCTTGCTGGCCGCTCTTTGGATTGAAAGGAGCTCTTGCATCTGATCCATCCATCC 4 0 3' arm Saccharum_officinarum mirbase MIR159 1e-61 sof-MIR159a 7e-131 -108 ..((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..((((((....(((((((((.(.(((..(((.(((((....((((...(((((((((..((((((....))))))......((((.((.((((((........))))).).....)).)))))))))))))...))))....))))).)))..))).).))))..))))))).))))..)).))))).))).)))))))).))).)).))))))..)))). (-108.00)