mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGCACTGCCTCTTCCCTGGC CAGGGATGAGGCAGAGCATGG AGAAGATGGGTATGGTTGGAGACAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCCATCAACAAAATTTCCAATTTCTGTCCTCCGCTAGGCCGCTACTGCATTTATGTTTGCTTGCTCACAAAACGGAGGGATTTGTGAGAGTTATCAGGCAGAAAGAACAAAGAAGGTGCCTCCCTGGTGAAGTGGTGATGGCCTGACCTGAGAGGGCTGAGAGCTCAGCTGGTGTCCTGGTGTTGTTGCTTCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCCACCGTTGCCCTTGC 4 0 3' arm Saccharum_officinarum mirbase MIR408 0.000000000000001 sof-MIR408c 4e-160 -119 .......(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((...((((...........((((.((((((((.(((((((.(((..(.......((((((((((((((((.(.....).))))))))......))))))))...............(((.....)))...)..))).)))))))...)).)))))).)))).....((..(....)..))))))..))))).)))).))).))))))).)))))).))))..)))).))))).... (-119.00)