mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTTCTCTCTCTGTCA TGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGCCTTTCTTGCATGATGAATGAGTGGATTCATGCTCGAAGCTATGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCA 1 2 5' arm Sorghum_bicolor mirbase mir-156 1e-25 ssp-MIR156 6e-33 -46.62 .(((((((((((((((((((.((((((....(((..((((((.............))))))..))))))))).)))))))).))))).)))))). (-46.62)