mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGGCGCAGTGGTTTATCGATC GGGCGCAGTGGTTTATCGATCTCTTCCTTGCCTTGTGCTAGTCCAGAAGTAGTGGTGGTTCAAGCGTTTATTGCTGCAATAACTTGCAAAACAACGCGGGAATCGATCGATAAACCTCTGCATCCAG 5 0 3' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR162_2 1e-66 zma-MIR162 1e-28 -51.7 ((..((((.((((((((((((..(((((.((.((((((.(((......((((..((((.........))))..))))....))).))...)))).)))))))..)))))))))))).))))..)).. (-51.70)