mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGTGTTCTCCTTCTCCAT TGGAGAAGCAGGGCACGTGCATGCTCCTAACTTCTCGCGCGCTCCTCTCCGCCGAGATCCATCGTTCATCTATATCTCCATGGATATGGAGCTATATATGGACTGGATCGCGGAGAGAAAGCTAGCTAGTATACTGCACGCACGTGTTCTCCTTCTCCAT 2 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR164 3e-86 zma-MIR164a 0.0000005 -80.3 ((((((((.(((((((((((.(((.....(((....((..(((.((((((((...((((((..((((((.((((.((((((....)))))).)))).))))))))))))))))))))..)))..)).))).....))).))))))))))).)))))))). (-80.30)