mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CACGTGCTCCCCTTCTCCACC GTTGGAGAAGCAGGGCACGTGCAGAGACACGCCGGCCGGAGCACGGCCGCCGCCGATAGATCGACCTCGCACTCGCACTCGCACACCAGCTGCGTCTGCGTGTGGATGAGGTCGAGATCGTCGTCGGTCGAAGCTAGCGAGGAACCTCTTGCTTGTTGCTTCACCCGCTAGCTCCTGCACTGCACGTGCTCCCCTTCTCCACCAT 2 0 5' arm Sorghum_bicolor mirbase MIR164 5e-113 zma-MIR164g 0.000000000000003 -107.4 (.((((((((..((((((((((((.(......).((.(((((..(((((.((.((((...((((((((((((.((((..((((.......))))..)))).)))..))))))))).)))).)).)))))(((((.(((((((....)))))))....)))))........))))).)).))))))))))))..)))))))).).. (-107.40)